| 초록 |
진정한 생명현상의 이해를 위해서는 개개의 유전자, 단백질만을 타겟으로 한 연구가 아니라, 이들 사이의 전체적인 상호작용, 네트워크를 이해해야만 한다. 이른바 대량분석(High-throughput)이라는 새로운 실험방법은 생명현상의 메커니즘을 밝히는데 커다란 역할을 할 것으로 기대되고 있으며, 이러한 대량분석 실험기법의 발달과 함께 대량분석실험에 맞는 데이터시스템이 필요하게 되고, 실험결과를 제대로 해석할 수 있는 생물정보학 시스템이 강하게 대두되고 있다. 대량실험방법중의 하나인 프로테오믹스(Proteomics)는 한 개체의 단백질 전체의 발현패턴, 상호작용을 연구하는 분야로서, 전체 유전자의 발현패턴을 연구하는 DNA chip에 비해서 생명현상의 직접적인 기능적 도구인 단백질을 이해한다는 측면에서, 그 효용성을 가늠할 수 있다. 이러한 연구를 위해서 실험결과 정리를 위한 일종의 데이터베이스가 요구되고, 데이터양이 너무 많고 데이터의 흐름이 복잡하며, 결과해석 역시 다량의 데이터를 처리해야 하는 만큼 수작업만으로는 곤란하며, 다양한 형태로 인터넷에 산재해 있는 분석툴을 이용해야 하는 등의 문제점등이 있다. 여기에 데이터베이스를 이용해야 할 이유가 있으며, 프로테오믹스 연구 작업공간(workbench) 역할을 할 통합된 형태의 시스템이 필요하다. 이러한 다양한 요구에 의해 바이오인포메틱스(주)에서는 생물정보학 방법론에 따라 ProtBench 시스템을 개발하였으며, 그 기능과 응용에 대해 언급하고자 한다. |
