화학공학소재연구정보센터
학회 한국화학공학회
학술대회 2002년 가을 (10/24 ~ 10/26, 서울대학교)
권호 8권 2호, p.4093
발표분야 생물화공
제목 Nearest-Neighbor Model을 이용한 DNA chip 설계 알고리즘
초록 DNA chip(또는 DNA microarray)은 각종 생명체가 가지고 있는 방대한 양의 유전정보를 빠른 시간에 대량으로 분석, 처리할 수 있는 신기술이자 현재의 Genomics 열풍을 가능하게 하는 강력한 무기라 할 수 있다[1,2]. 그 중 Gene Expression Array는 유전자 발현분석을 하는데 쓰이는 DNA chip으로서 mRNA에 대한 역전사 기술을 이용해서 만들어진 cDNA를 target DNA로 사용하므로써 유전자의 발현정도를 분석할 수 있는 가장 일반적인 DNA chip이다. 이때 DNA chip에 붙어 있는 probe의 선택은 DNA chip의 설계과정에서 가장 중요한 단계이다. 본 논문에서는 Nearest-Neighbor Model을 이용한 probe의 열역학적 특성을 계산하는 방법과 이를 기반으로 각 cDNA에 대한 최적의 probe를 찾는 설계 알고리즘을 제시하였다.
저자 제갈성준, 문일
소속 연세대
키워드 DNA Chip; Design Algorithm; Nearest-Neighbor Model
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