화학공학소재연구정보센터
학회 한국화학공학회
학술대회 2002년 가을 (10/24 ~ 10/26, 서울대학교)
권호 8권 2호, p.3897
발표분야 생물화공
제목 IgG binding domain of protein G 의 폴딩 현상에 대한 분자 수준의 해석 연구
초록 본 연구에서는 IgG binding domain of protein G 의 폴딩 현상을 분자 수준의 해석 방법인 over-damped Langevin dynamics 를 이용해서 예측하였다. 단백질 구조정보 데이터 베이스와 단백질 작용의 물리화학적 지식 등을 바탕으로 한 분자간 상호 작용을 topological constraints 와 함께 고려하여 protein G 의 폴딩 pathways, 이차 구조 형성 propensity, 그리고 alpha helix 와 2개의 beta hairpins 의 구조 형성과 안정성을 root mean square deviation (RMSD), local order parameter 그리고 number of helical segments 등을 통해서 조사하고 폴딩 pathways 에 대한 실험결과와 비교 분석 하였다.
저자 이승엽1, Shoji Takada2, 김도현
소속 1한국과학기술원 생명화학공학과, 2초미세화학공정센터
키워드 Protein folding simulation; Langevin dynamics; IgG binding domain of protein G
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