비휘발성, 무독성, 비폭발성의 청정용매이면서 원하는 물리화학적 특성을 임의로 조절할 수 있는 이온성액체의 생물화학공정에서 적용은 기존의 생물화학공정에서 부득이하게 사용하고 있는 환경 오염물질인 유기용매를 사용하지 않는 것 외에 생촉매의 반응성, 선택성, 안정성을 향상시킬 수 있으며, 목질계 바이오매스로부터 친환경적, 그리고 효율적으로 분리하여 바이오에너지와 고부가가치 화학물질들도 또한 생산할 수 있다. 이에 본 원고에서는 이온성액체에 대한 기본 지식과 함께 현재 이온성액체가 용매로서 효과적으로 응용되고 있는 효소반응 분야와 바이오매스 용해 및 활용분야에서의 최근 연구동향을 소개하고자 한다.